柴油机排烟控制系统开始工作后，PLC首先执行CPU自诊断程序，若CPU发生故障，PLC显示故障信号，系统停止工作。若系统自检正常，PLC顺序执行控制系统主程序，进行系统参数初始化，将3个变频器的初始频率归零，同时检测EM235模拟量输入模块工作状态，并给出模块正常工作信号。
当系统执行第2个扫描周期或系统处于待机状态时，系统不再执行初始化子程序，只判断变频器中间参数是否处于变频器正常频率范围，若超出频率上下限范围，则自动将其置为上下限的值。
自动模式下，系统启动后，PLC根据压差传感器测量值与设定值进行比较，首先判断副换热器两端的压差，若副换热器两端的压差没有超过设定值，则副换热器一台换热，另一台除冰。
当换热时，首先开启进风机，延时5s后，12个电动阀工作，打开进排风通道，同时启动柴油发电机组，系统根据外界环境和排烟口的温差控制变频风机进行自动变频，当新风温度与排烟温度差值超过规定值时，报警指示灯亮，系统仍处于工作状态。
2个压差传感器实时检测换热器两端的压力，自动进行换热器的切换。若2个压差传感器的压力值均大于设定值，报警指示灯亮，按下停止按钮，所有电动阀打开，进排风机和水泵关闭，系统停止运行。
